杨店医院现有：
    内科、儿科、外科、妇产科、口腔科、肛肠科、中医科、药剂科、放射科、化验室、护办室、B超科、心电图室、脑电图室、理疗针灸室、手术室、供应室、财务科、后勤科、防保站、一体化办公室等20多个科室。
杨店医院
    除能开展对急性农药中毒、心脑血管疾病、糖尿病、肾病、肿瘤等危重病人救治外，还进一步开展了肝、胆、脾、肾、胃大部切除术以及膀胱切开取石、剖腹产、胃肠及妇科肿瘤切除术、甲状腺、乳腺肿瘤切除术等。B超、放射、化验等医技科室的诊断已达市县级医院诊断水平。口腔科对反咬合、口吃、镶牙、补牙、隐形仪齿、光固化、种植牙、牙再生、拔髓术、牙齿美容等诊治有独到之处。
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    中医科对妇科疾病，尤其是对不孕症有显著诊断效果。